Algunos hongos son perjudiciales para el ser humano y pueden causar enfermedades atacando al sistema respiratorio, piel, mucosas, uñas...También hay que ser muy cuidadosos al recogerlos para ingerirlos porque pueden ser tóxicos. Otros dañan a las plantas y son capaces de destruir cosechas.

Sin embargo, otros son beneficiosos. De algunos mohos se obtienen antibióticos y otros medicamentos. Algunas setas son un alimento exquisito como la trufa, el níscalo o el champiñón. Las levaduras se emplean en la fabricación de productos de repostería y en la elaboración de bebidas alcohólicas, como el vino.

Además, los hongos que viven en el suelo descomponen los restos de seres vivos formando el humus del que se alimentan las plantas.